电影于1991年6月29日星期六由东宝公司上映。故事发生在电视剧完结三年后。电视剧中的角色仅剩下娜迪亚、吉恩、格兰迪斯、桑森和汉森五人。鹦鹉螺号的船员，包括玛丽、金、艾尔顿和厄勒克特拉，只出现在娜迪亚的闪回片段中。这些闪回片段在电影前期断断续续地播放了约30分钟，动画也沿用了电视剧中的片段。厄勒克特拉和尼摩船长的孩子们，他们的存在在电视剧的最后一集中才被揭示，但也没有出现。该项目最初计划由Gainax制作，但导演庵野秀明以电视剧制作倦怠为由退出。Gainax在完成剧情和角色设计后耗尽了预算，最终未能完成电影制作。其余部分由Group TAC制作。Gainax负责剧情、设计以及电影制作期间电视版摘要的剪辑。或许正因如此混乱的局面，影片本身并没有获得很高的评价。据武田康弘的回忆录记载，他拖欠TAC集团的5000万日元，直到《新世纪福音战士》成功后才得以偿还。
当剧场版《蓝宝石之谜》的光影在屏幕上流转，那个关于冒险、成长与人性的故事再次焕发出跨越时空的魅力。这部改编自儒勒·凡尔纳《海底两万里》的作品，并未拘泥于原著框架，而是以19世纪末的巴黎为起点，编织出一个融合科幻、蒸汽朋克与人文思考的宏大叙事。娜迪亚与约翰的相遇如同命运的齿轮开始转动，从埃菲尔铁塔的邂逅到马戏团舞台的追逐，再到深海潜艇“鹦鹉螺号”的壮阔航行，每一个场景都承载着对未知世界的好奇与敬畏。
角色塑造是影片最引人入胜的亮点。娜迪亚作为核心人物，其形象突破了传统动画中女性角色的刻板印象——她既是带着神秘蓝宝石逃亡的马戏团少女，也是背负异族身份的孤独探索者。当她面对身世谜团时眼中闪烁的迷茫，或是在危机时刻展现出的果敢，都被配音演员鹰森淑乃以细腻的声线诠释得淋漓尽致。而约翰对科学的痴迷与发明热情，则通过日高法子充满活力的演绎跃然眼前，少年在冒险中逐渐理解责任与爱的过程，成为推动剧情发展的情感纽带。配角群像同样令人印象深刻：尼莫船长的决绝与悲悯，葛兰蒂斯组织的复杂动机，都在有限篇幅中勾勒出立体的人性图谱。
剧场版的叙事结构呈现出独特的艺术张力。导演樋口真嗣巧妙地将TV版的39集精华浓缩为电影语言，既保留了原作中“寻找故乡”的核心线索，又通过蒙太奇手法强化了戏剧冲突。从巴黎万国博览会的蒸汽朋克美学，到亚特兰蒂斯文明的史诗对决，画面在恢弘场景与细节刻画间自如切换。当“鹦鹉螺号”冲破海浪的瞬间，观众能清晰感受到技术革新带来的震撼；而小狮王与伙伴们的互动，又以童趣视角平衡了沉重主题。这种张弛有度的节奏把控，让不同年龄层的观众都能找到情感共鸣点。
影片的主题表达超越了简单的冒险故事范畴。蓝宝石所象征的不仅是外星文明遗产，更是人类对自身存在的终极追问。当娜迪亚站在两个文明的断层线上，她选择的不是仇恨而是理解；当约翰用自制飞机对抗巨型机械兽时，体现的是对科学精神的纯粹信仰。这些情节暗含着对战争、偏见与环境问题的深刻反思，使得作品在娱乐性之外具备了哲学深度。